SKRIPSI
Sintesis dan Kajian Moleculer Docking senyawa 2',3'-dimetoksi flavonol sebagai inhibitor main protease (Mpro) virus SARS-CoV-2
Flavonoid merupakan golongan senyawa bahan alam yang telah dilaporkan memiliki berbagai potensi aktivitas biologis. Salah satu potensinya adalah sebagai inhibitor Main Protease (MPro) SARS-CoV-2. Penelitian ini bertujuan untuk mensintesis senyawa 2?,3?-dimetoksi flavonol (F23) dan mengeksplorasi potensi senyawa tersebut sebagai inhibitor MPro SARS-CoV-2. Sintesis senyawa F23 dilakukan melalui reaksi Flynn-Algar-Oyamada dengan metode pengadukan pada temperatur kamar dan kajian molecular docking dilakukan menggunakan struktur kristal MPro SARS-CoV-2 yang diunduh dari website RCSB Protein Data Bank (PDB ID: 6M2N) menggunakan perangkat lunak MOE 2022.19.01. Hasil sintesis senyawa F23 memberikan rendemen produk sebesar 67,2 % dan struktur produk hasil sintesis telah dikonfirmasi melalui analisis spektroskopi UV-Vis, FT-IR, 1H NMR, 13C NMR, dan HRMS. Selanjutnya, hasil kajian molecular docking menunjukkan bahwa senyawa F23 dapat membentuk interaksi dengan beberapa residu asam amino pada sisi aktif MPro SARS-CoV-2 dengan nilai energi bebas pengikatan yang lebih negatif dibandingkan baicalein sebagai inhibitor pembanding, yaitu sebesar -8,02 kcal/mol dan nilai RMSD sebesar 0,95. Berdasarkan visualisasi hasil docking, senyawa F23 berinteraksi dengan kedua asam amino pada catalytic dyad, yaitu His41 dan Cys145, dimana pengikatan suatu ligan pada kedua asam amino ini berperan penting dalam proses penghambatan aktivitas enzim MPro SARS-CoV-2. Selain itu, senyawa F23 juga membentuk ikatan hidrogen dengan residu asam amino Glu166 yang merupakan salah satu residu penting dalam proses pengikatan ligan ke sisi aktif MPro SARS-CoV-2. Interaksi-interaksi tersebut juga teramati pada baicalein sebagai inhibitor pembanding (kontrol positif). Dengan demikian, dapat disimpulkan bahwa senyawa F23 memiliki potensi untuk dikembangkan sebagai inhibitor MPro SARS-CoV-2
Tidak tersedia versi lain