SKRIPSI
Sintesis dan Studi Molecular Docking Senyawa Etil Ester 2',4'-DimetoksiFlavonol sebagai Inhibitor Main Protease SARS-CoV-2
Flavonoid merupakan salah satu metabolit sekunder yang menarik perhatian banyak peneliti untuk mengeksplorasi potensinya sebagai inhibitor Main Protease (MPro) SARS-CoV-2. Penelitian ini bertujuan untuk mensintesis senyawa etil ester 2?,4?-dimetoksi flavonol (EF24) dan mengeksplorasi potensi senyawa tersebut sebagai inhibitor MPro SARS-CoV-2. Sintesis senyawa EF24 dilakukan melalui dua tahap reaksi. Reaksi sintesis diawali dengan sintesis flavonol F24 melalui reaksi Algar-Flynn-Oyamada dan dilanjutkan dengan reaksi sintesis etil ester flavonol EF24 melalui reaksi eter Williamson dengan metode stirrer pada temperatur kamar. Studi molecular docking dilakukan terhadap struktur kristal MPro SARS-CoV-2 yang diunduh dari website RSCB Protein Data Bank (PDB ID: 6M2N) menggunakan perangkat lunak MOE 2022.02. Senyawa EF24 diperoleh dalam bentuk kristal putih dengan rendemen 53,16% dan struktur produk hasil sintesis telah dikonfirmasi melalui analisis spektroskopi UV-Vis, FT-IR, 1H NMR dan 13C NMR. Selanjutnya, hasil studi molecular docking menunjukan bahwa senyawa EF24 dapat membentuk interaksi dengan beberapa residu asam amino pada sisi aktif MPro SARS-CoV-2 dengan nilai energi bebas ikatan sebesar -9,16 kcal/mol, lebih negatif dibandingkan dengan baicalein (kontrol positif). Berdasarkan visualisasi hasil docking, senyawa EF24 berinteraksi dengan kedua asam amino pada catalityc dyad, yaitu His41 dan Cys145. Selain itu, senyawa EF24 juga membentuk ikatan hidrogen dengan residu asam amino Glu166 yang merupakan salah satu residu penting dalam proses pengikatan ligan ke sisi aktif MPro SARS-CoV-2. Namun, berdasarkan hasil overlay pose pengikatan senyawa EF24 teramati sedikit berbeda dengan pose pengikatan kontrol positif. Dengan demikian, dapat disimpulkan bahwa senyawa EF24 memiliki potensi memberikan aktivitas moderate sebagai inhibitor Mpro SARS-CoV-2.
Tidak tersedia versi lain