Covid-19 merupakan penyakit menular yang disebabkan oleh SARS CoV-2. salah satu strategi potensial dalam pencarian terapi baru yaitu dengan pendekatan network pharmacology dan molecular docking yang memanfaatkan basis data bioinformatika untuk mengidentifikasi hubungan senyawa dan target protein. Penelitian ini bertujuan untuk mengetatui potensi senyawa flavonol sebagai kandidat inhibitor baru bagi Covid-19 secara in silico. Data senyawa flavonol diperoleh dari database KNApSAcK dan disaring berdasarkan aturan Lipinski Rule of Five menggunakan SwissADME untuk memastikan baik tidaknya bioavailabilitas senyawa tersebut. Target protein flavonol diprediksi menggunakan SwissTargetPrediction dan target protein dari Covid-19 diprediksi menggunakan GeneCard serta dianalisis keterkaitan antara protein flavonol dengan Covid-19 melalui Diagram Venn. Dari 25 senyawa flavonol yang diperoleh, didapatkan sebanyak 20 senyawa yang berpotensi sebagai kandidat inhibitor bagi SARS CoV-2. Pada String-DB didapatkan sebanyak 16 protein target. Protein target utama yang akan digunakan pada studi docking adalah ACE2 (PDB ID: 7BZ5), ACE2 merupakan reseptor utama yang digunakan SARS CoV-2 untuk memasuki sel inang. Preparasi protein dan ligan dilakukan dengan BIOVIA Discovery Studio Visualizer dan Molecular Operating Environment (MOE) 2022.02, diikuti simulasi docking menggunakan MOE. Parameter yang diamati mencakup nilai energi bebas ikatan (S), Root Mean Square Deviation (RMSD), jenis ikatan (hidrogen, van der Waals, dan hidrofobik), serta kecocokan interaksi residu asam amino dibandingkan dengan kontrol positif (baicalein). Hasil docking menunjukkan bahwa senyawa SF6, SF8, SF11, dan SF16 memiliki afinitas ikatan yang paling baik dari baicalein, yaitu dengan nilai energi bebas ikatan secara berurutan -6,0218; -6,3462; -6,5226; dan -6,2666 kcal/mol, serta interaksi residu asam amino yang serupa dengan kontrol positif. Berdasarkan hasil tersebut, senyawa SF6, SF8, SF11, dan SF16 berpotensi sebagai kandidat inhibitor SARS-CoV-2 dan diperlukan penelitian lanjutan secara in vitro dan in vivo untuk validasi aktivitas antiviral.

Tidak tersedia versi lain

Tidak Ada Data