SKRIPSI
SINTESIS DAN KAJIAN MOLECULAR DOCKING SENYAWA 3?,4?,5?-TRIMETOKSI FLAVONOL SEBAGAI INHIBITOR MAIN PROTEASE (MPro) SARS-COV-2
Flavonoid merupakan senyawa metabolit sekunder yang telah dilaporkan menunjukkan beragam aktivitas biologis. Beberapa senyawa flavonoid dilaporkan berpotensi sebagai antivirus. Penelitian ini bertujuan untuk mensintesis senyawa 3?,4?,5?-trimetoksi flavonol (F345) dan mengeksplorasi potensi senyawa tersebut sebagai inhibitor MPro SARS-CoV-2. Sintesis senyawa F345 dilakukan melalui reaksi Flynn-Algar-Oyamada (FAO) dengan metode pengadukan pada suhu kamar dan kajian molecular docking dilakukan menggunakan struktur kristal MPro SARS-CoV-2 yang diunduh dari website RCSB Protein Data Bank (PDB ID: 6M2N) menggunakan perangkat lunak MOE 2022.19.01. Hasil sintesis senyawa F345 memberikan rendemen produk sebesar 50,52% dan struktur produk hasil sintesis telah dikonfirmasi melalui analisis spektroskopi UV-Vis, FT-IR, 1H NMR, 13C NMR, dan HRMS. Selanjutnya, Hasil kajian molecular docking menunjukkan bahwa senyawa F345 dapat membentuk ikatan hidrogen dengan His164, serta dapat membentuk interaksi lainnya dengan His41 dan Cys145 yang merupakan catalityc diad pada sisi pengikatan enzim tersebut, dengan nilai energi bebas pengikatan sebesar -9.02 kcal/mol dan nilai RMSD sebesar 1.37. Dalam hal ini, nilai binding free energy senyawa F345 tersebut lebih negatif jika dibandingkan dengan baicalein sebagai kontrol positif. Sehingga dapat disimpulkan bahwa senyawa F345 tersebut memiliki potensi yang lebih baik dari baicalein dalam membentuk kompleks dengan MPro SARS CoV-2.
Tidak tersedia versi lain