SKRIPSI
Sintesis Dan Kajian Molecular Docking Senyawa 3?,4?-Dimetoksi Flavonol Sebagai Inhibitor Main Protease (Mpro) Sars-Cov-2
Flavonoid merupakan golongan senyawa bahan alam yang telah dilaporkan memiliki berbagai potensi aktivitas biologis. Salah satu potensinya adalah sebagai inhibitor Main Protease (MPro) SARS-CoV-2. Penelitian ini bertujuan untuk mensintesis senyawa 3?,4?-dimetoksi flavonol (F34) dan mengeksplorasi potensi senyawa tersebut sebagai inhibitor MPro SARS-CoV-2. Sintesis senyawa F34 dilakukan melalui reaksi Flynn-Algar-Oyamada dengan metode pengadukan pada temperatur kamar dan kajian molecular docking dilakukan menggunakan struktur kristal MPro SARS-CoV-2 yang diunduh dari website RCSB Protein Data Bank (PDB ID: 6M2N) menggunakan perangkat lunak MOE 2022.09.01. Hasil sintesis senyawa F34 memberikan rendemen produk sebesar 75,23 % dan struktur produk hasil sintesis telah dikonfirmasi melalui analisis spektroskopi UV-Vis, FT-IR, dan 1H-NMR. Selanjutnya, hasil kajian molecular docking menunjukkan bahwa senyawa F34 dapat membentuk interaksi dengan beberapa residu asam amino pada sisi aktif MPro SARS-CoV-2 dengan nilai energi bebas pengikatan yang lebih negatif dibandingkan baicalein sebagai inhibitor pembanding, yaitu sebesar -8,42 kcal/mol dan nilai RMSD sebesar 1,03. Berdasarkan visualisasi hasil docking, senyawa F34 berinteraksi dengan kedua asam amino pada catalytic dyad, yaitu His41 dan Cys145, dimana pengikatan suatu ligan pada kedua asam amino ini berperan penting dalam proses penghambatan aktivitas MPro SARS-CoV-2. Selain itu, senyawa F34 juga membentuk ikatan hidrogen dengan residu asam amino Gly143 dan His164. Dengan demikian, dapat disimpulkan bahwa senyawa F34 dapat diprediksi berpotensi sebagai inhibitor MPro SARS-CoV-2.
Tidak tersedia versi lain