SKRIPSI
Sintesis dan studi molecular docking senyawa etil ester 2?,4?,5?-Trimetoksi flavonol sebagai inhibitor main protease (Mpro) SARS-CoV-2
Flavonoid merupakan golongan senyawa bahan alam yang telah dilaporkan memiliki berbagai potensi aktivitas biologis. Salah satu potensinya adalah sebagai inhibitor Main Protease (MPro) SARS-CoV-2. Penelitian ini bertujuan untuk mensintesis senyawa etil ester 2',4',5'-trimetoksiflavonol (EF245) dan mengeksplorasi potensi senyawa tersebut sebagai inhibitor MPro SARS-CoV-2. Sintesis senyawa EF245 dilakukan melalui dua tahap reaksi. Reaksi sintesis diawali dengan sintesis flavonol F245 melalui reaksi Algar-Flynn-Oyamada dan dilanjutkan dengan reaksi sintesis etil ester flavonol EF245 melalui reaksi sintesis eter Williamson dengan metode pengadukan pada temperatur kamar. Selanjutnya, kajian molecular docking dilakukan terhadap struktur kristal MPro SARS-CoV-2 yang diunduh dari website RCSB Protein Data Bank (PDB ID: 6M2N) menggunakan perangkat lunak MOE 2022.02. Hasil sintesis senyawa EF245 memberikan rendemen produk sebesar 57,96%. Struktur produk hasil sintesis telah dikonfirmasi melalui analisis spektroskopi UV-Vis, FT-IR, 1H NMR, dan 13C NMR. Hasil kajian molecular docking menunjukkan bahwa senyawa EF245 dapat membentuk interaksi dengan beberapa residu asam amino pada sisi aktif MPro SARS-CoV-2 dengan nilai energi bebas pengikatan yang lebih negatif dibandingkan baicalein sebagai inhibitor pembanding, yaitu sebesar -9,70 kcal/mol dan nilai RMSD sebesar 1,74. Berdasarkan visualisasi hasil docking, senyawa EF245 berinteraksi dengan kedua asam amino pada catalytic dyad, yaitu His41 dan Cys145, yang berperan penting dalam aktivitas proteolitik enzim MPro SARS-CoV-2. Selain itu, senyawa EF245 juga membentuk ikatan hidrogen dengan residu asam amino Glu166 yang merupakan salah satu residu penting dalam proses pengikatan ligan ke sisi aktif MPro SARS- CoV-2. Interaksi-interaksi tersebut juga teramati pada baicalein sebagai inhibitor pembanding (kontrol positif). Namun, berdasarkan hasil superimposisi, pose pengikatan senyawa EF245 teramati sedikit berbeda dengan pose pengikatan kontrol positif. Dengan demikian, dapat disimpulkan bahwa berdasarkan hasil kajian molecular docking ini menunjukkan bahwa senyawa EF245 berpotensi memiliki aktivitas penghambatan moderate terhadap MPro SARS-CoV-2.
Tidak tersedia versi lain