SKRIPSI
Simulasi Molecular Dynamic (Md) Senyawa Analog Kalkon Sebagai Inhibitor Untuk Sel Kanker Hati Hepg2
Senyawa kalkon merupakan senyawa yang berasal dari alam yang sudah terbukti memiliki aktivitas sebagai antikanker. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kestabilan senyawa analog kalkon yang telah di-docking sebagai inhibitor kanker hati HepG2. Penelitian ini menggunakan 3 senyawa analog kalkon yang diperoleh dari penelitian sebelumnya dengan menggunakan sorafenib sebagai kontrol positif. Studi simulasi molecular dynamic ini dilakukan dengan bantuan komputer menggunakan software MOE 2007.09. Data hasil simuasi berupa nilai energi bebas ikatan (kcal/mol), ikatan hidrogen, dan kesamaan asam amino yang menunjukkan kestabilan interaksi ligan senyawa kalkon terhadap asam amino pada reseptor. Hasil molecular dynamic menunjukkan bahwa dari 3 senyawa yang disimulasikan senyawa 2 adalah yang paling stabil karena memiliki nilai energi bebas ikatan yang rendah yaitu -4.401,82 kcal/mol dan terdapat asam amino yang membentuk ikatan hidrogen dengan sisi aktif reseptor yaitu Arg815, serta memiliki 9 residu asam amino yang sama dengan hasil docking.
Tidak tersedia versi lain