SKRIPSI
Simulasi Molecular Dynamic (Md) Senyawa Analog Kalkon Sebagai Inhibitor Sel Kanker Payudara Mcf-7
Senyawa kalkon merupakan senyawa yang berasal dari alam yang sudah terbukti memiliki aktivitas sebagai antikanker. Penelitian ini bertujuan untuk melihat kestabilan senyawa analog kalkon yang telah di docking sebagai inhibitor kanker payudara MCF-7. Penelitian ini menggunakan 3 struktur kompleks protein 5P21-analog kalkon hasil docking yang diperoleh dari penelitian sebelumnya dengan menggunakan doxorubicin sebagai kontrol positif. Studi simulasi molecular dynamic ini dilakukan dengan komputer menggunakan software MOE 2007.09. Data hasil simulasi berupa nilai konformasi, ikatan hidrogen, dan kesamaan asam amino yang menunjukkan kestabilan yang menunjukkan kestabilan interaksi ligan senyawa kalkon terhadap asam amino pada reseptor. Hasil molecular dynamic menunjukkan bahwa dari 3 senyawa yang disimulasikan senyawa 2 adalah yang paling stabil karena memiliki nilai konformasi rendah yaitu -2587.266 dan terdapat asam amino yang membentuk ikatan hidrogen dengan sisi aktif reseptor yaitu Arg149, serta memiliki 3 residu asam amino yang sama dengan hasil docking.
Tidak tersedia versi lain